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    作物抗逆育種領域的“科技與狠活” :高通量植物表型+分子組學

    發(fā)布時間: 2026-01-29  點擊次數(shù): 423次

    在氣候變化加劇、糧食安全受嚴峻挑戰(zhàn)背景下,作物抗逆育種與脅迫響應機制研究是農業(yè)科學核心議題。傳統(tǒng)研究存在局限,要么僅宏觀觀察表型,難觸及分子調控本質;要么聚焦單一組學微觀解析,缺與實際表型動態(tài)關聯(lián),難破解復合脅迫復雜調控網絡。PlantScreen高通量植物表型系統(tǒng)和多組學技術的聯(lián)合應用,正逐漸成為抗逆育種研究領域里關鍵的技術手段。該系統(tǒng)借助表型數(shù)據(jù),捕捉植物對外界脅迫的宏觀響應,運用多組學解析分子調控機制,迅速建立表型 - 組學的對應關系,揭示作物脅迫響應的多水平調控邏輯,為抗逆品種培育提供了高通量、高精度的技術支持。

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    馬鈴薯作為四大主糧,雖兼具水分和空間利用效率優(yōu)勢,卻對多重脅迫極為敏感,單一或復合脅迫可導致減產甚至絕收。一項由德國、荷蘭、英國、捷克等7國科研團隊的聯(lián)合研究在《Plant Physiology》發(fā)表重磅成果——借助PlantScreen™高通量表型平臺的動態(tài)監(jiān)測能力,結合轉錄組、蛋白質組、代謝組、激素組的多組學整合分析,成功解析了馬鈴薯對單一及復合非生物脅迫的全維度響應機制。

     

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    動態(tài)表型監(jiān)測:PlantScreen捕獲脅迫響應的實時軌跡"

    在這項覆蓋5種脅迫處理(高溫、干旱、水澇、高溫+干旱、高溫+干旱+水澇)的研究中,PlantScreen平臺承擔了“全天候表型監(jiān)測官"的角色。研究團隊選取中度抗逆的馬鈴薯Desirée品種,通過平臺集成的RGB成像、葉綠素熒光成像、熱成像等多傳感器模塊,實現(xiàn)了每日無侵入式數(shù)據(jù)采集。

    形態(tài)學特征來看,PlantScreen精準捕捉到不同脅迫下的獨特表型信號:高溫脅迫導致馬鈴薯葉片上卷(避熱形態(tài)建成),水澇處理1天內即引發(fā)葉片偏上生長并伴隨生長停滯,而高溫+干旱復合脅迫下,植株體積、冠層面積的衰減速率顯著高于單一脅迫。這些動態(tài)變化數(shù)據(jù),為后續(xù)區(qū)分“脅迫起始點"“響應峰值期"“恢復關鍵期"提供了直接依據(jù)。

    生理功能監(jiān)測上,PlantScreen的葉綠素熒光成像技術精準量化了光合系統(tǒng)IIPSII)的運行效率(QY_Lss)和開放反應中心比例(qL_Lss),發(fā)現(xiàn)水澇脅迫3天后PSII效率顯著下降,而高溫脅迫對光合系統(tǒng)的損傷具有持續(xù)性,即使脅迫解除也難以恢復至對照水平。熱成像模塊捕獲的冠層與空氣溫差(ΔT),則揭示了不同脅迫下的氣孔行為策略:干旱和水澇時氣孔快速關閉導致ΔT升高,高溫時氣孔開放散熱則使ΔT降低,這些生理表型數(shù)據(jù)為解讀激素和代謝物變化提供了關鍵線索。

    值得一提的是,PlantScreen自動化數(shù)據(jù)采集能力保障了實驗的高通量與重復性。6組處理、36株表型監(jiān)測植株,每日生成的68項形態(tài)-生理變量,通過平臺自帶的PlantScreenAnalyzer軟件自動提取,為后續(xù)與多組學數(shù)據(jù)的整合奠定了堅實基礎。

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    表型-組學聯(lián)動:PlantScreen解鎖分子機制的解碼鑰匙"

    如果說多組學數(shù)據(jù)是解析脅迫響應的“分子密碼本",那么PlantScreen獲取的表型數(shù)據(jù)就是的“鑰匙"。該研究通過機器學習算法篩選出6個核心表型變量(qL_LssPSII熒光效率、冠層面積、ΔT、植株緊湊度、水分消耗),與轉錄組的14個標記基因、蛋白質組的36個功能蛋白、代謝組的22種核心代謝物及13種植物激素進行整合分析,實現(xiàn)了“表型變化-分子響應"的精準對應。

    研究發(fā)現(xiàn),水澇脅迫下PlantScreen監(jiān)測到的氣孔快速關閉,與激素組中ABA及其降解產物PADPA的顯著積累高度同步,證實了水澇脅迫會激活類似干旱的ABA信號通路——這一發(fā)現(xiàn)依賴于表型數(shù)據(jù)捕捉到的“瞬時響應"與激素組學的“時序變化"的聯(lián)動分析。而高溫+干旱復合脅迫下,PlantScreen記錄到的植株體積驟減變化,對應著代謝組中組氨酸、支鏈氨基酸的大量積累,以及蛋白質組中熱休克蛋白(HSP70HSP90)的富集,揭示了復合脅迫通過“代謝重構+蛋白保護"應對脅迫的協(xié)同機制。

    更重要的是,PlantScreen捕獲的動態(tài)表型數(shù)據(jù),糾正了傳統(tǒng)“靜態(tài)采樣"的局限。例如,單一干旱脅迫下,植株在脅迫第7天出現(xiàn)ΔT顯著升高,此時轉錄組中P5CS(脯氨酸合成關鍵基因)和RD29B(干旱標記基因)才達到表達峰值,而PlantScreen的每日監(jiān)測明確了“表型變化先于分子響應"的時間差,為理解脅迫適應的調控時序提供了直接證據(jù)。

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    育種應用潛力:PlantScreen加速抗逆品種培育的“轉化橋梁"

    該研究的核心價值不僅在于機制解析,更在于為抗逆育種提供了可落地的高通量分析技術方案——而PlantScreen正是連接基礎研究與育種應用的“轉化橋梁"。本研究通過PlantScreen表型數(shù)據(jù)與多組學數(shù)據(jù)的整合,篩選出一批與關鍵表型強關聯(lián)的分子標記:如與光合效率維持相關的HSP70基因、與水分利用效率關聯(lián)的DPA代謝物、與塊莖產量保護相關的SP6A基因。

    這些標記的篩選,依賴于PlantScreen對“目標表型"的精準量化——例如,通過平臺監(jiān)測到的“脅迫后恢復能力"這一關鍵表型,鎖定了ABA代謝通路的核心作用,為育種家提供了可直接用于分子標記輔助選擇的靶點。此外,PlantScreen的高通量特性可支持大規(guī)模種質資源的快速篩選,相較于傳統(tǒng)表型鑒定效率提升數(shù)十倍,為抗逆品種的快速培育提供了技術支撐。

    PlantScreen作物脅迫研究進入表型-組學"整合時代

    這項跨國研究充分證明,PlantScreen高通量表型平臺不僅是表型數(shù)據(jù)的“采集器",更是多組學研究的“核心錨點"。其自動化、多維度、動態(tài)監(jiān)測的優(yōu)勢,解決了傳統(tǒng)研究中表型與分子數(shù)據(jù)脫節(jié)的痛點,實現(xiàn)了“形態(tài)-生理-分子"的全鏈條解析。

    在氣候變化加劇的今天,作物抗逆研究亟需從“單一脅迫"轉向“復合脅迫",從“靜態(tài)分析"轉向“動態(tài)追蹤"。PlantScreen平臺的應用,不僅為馬鈴薯抗逆研究提供了新范式,更為小麥、玉米、番茄等其他作物的脅迫響應研究提供了可復制的技術方案。未來,隨著表型組學與多組學整合技術的不斷成熟,PlantScreen將持續(xù)賦能抗逆育種,助力培育更多氣候適應性強、產量穩(wěn)定的作物品種,為糧食安全筑牢技術屏障。

    北京易科泰攜手PSI表型研究中心,先后在國內安裝運行多臺PlantScreen高通量植物表型成像分析平臺,該表型平臺集成了定制光源、自動澆灌稱重、多種表型成像單元及自動化系統(tǒng),目前裝機近百臺。客戶涵蓋幾乎所有遺傳育種表型研究機構或公司(北京易科泰PlantScreen國內外用戶名錄),如國際水稻研究所、瓦格寧根大學及巴斯夫、杜邦先鋒等農業(yè),在高通量植物表型分析領域處于市場地位。

    杜邦先鋒:PlantScreen表型成像分析系統(tǒng)用于玉米育種

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    德國IPK大型PlantScreen植物表型成像平臺

     

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    荷蘭瓦格寧根大學PlantScreen傳送帶版高通量植物表型成像分析系統(tǒng)

     

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    澳大利亞悉尼科技大學PlantScreen藻類表型成像分析系統(tǒng)

     

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    匈牙利生物科學研究中心: PlantScreen 植物根系表型成像分析系統(tǒng)

     

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    北京易科泰PlantScreen高通量植物表型成像分析平臺鏈接 


    1. Zagor??ak M, Abdelhakim L, Rodriguez-Granados N Y, et al. Integration of multi-omics data and deep phenotyping provides insights into responses to single and combined abiotic stress in potato[J]. Plant physiology, 2025, 197(4): kiaf126.


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